Este conselho é constituído pelos fundadores, por Professores de Universidades e de Institutos Superiores e por entidades que têm protocolo com o Museu e tem como finalidade principal acompanhar cientificamente o projeto, bem como dar pareceres sobre as linhas orientadoras das suas atividades.
| Alberto da Silva | Universidade Federal da Paraíba – Brasil |
| Albertino Gonçalves | Universidade do Minho – Portugal |
| Ana Pessoa dos Santos | Directora do Centro de Memória e Informação da Fundação Casa de Rui Barbosa – Rio de Janeiro |
| Ana Sílvia Volpi Scott | Universidade do Vale do rio dos Sinos – Unisinos – Brasil |
| Armando Oliveira | Universidade Aberta – Portugal |
| Aurélio de Oliveira | Faculdade de Letras do Porto |
| Eduarda Moreira da Silva Vieira | Universidade Portucalense |
| Fernanda Paula Maia | Universidade do Porto – Instituto de História Moderna Portugal |
| Geraldo Sá Peixoto Pinheiro | Universidade Federal do Amazonas – Brasil |
| Henrique Barreto Nunes | Arquivo Distrital de Braga e Biblioteca Pública – U.Minho |
| Henrique Rodrigues | Instituto Politécnico de Viana do Castelo – Portugal |
| Henrique Terena | Conselho Nacional de Pastores e Lideres Evangélicos Indígenas – Brasil |
| Hilda Pivaro Stadniky | Universidade Federal de Maringá – Brasil |
| Isilda Braga da Costa Monteiro | Universidade do Porto – Instituto de História Moderna |
| Jacinto Godinho | Universidade Nova de Lisboa – Portugal |
| Isménia de Lima Martins | Universidade Federal Fluminense, UFF |
| João Peixoto | Universidade Técnica de Lisboa – Portugal |
| Joaquim da Costa Leite | Universidade de Aveiro – Portugal |
| Jorge Fernandes Alves | Universidade do Porto – Portugal |
| José Carlos Teixeira | University of British Columbia -Canada |
| José Ribeiro | Universidade Aberta |
| José Correia das Neves | Instituto Histórico e Geográfico (Minas Gerais) – Brasil |
| José Mário Coelho | PTVirtual – Jornalista |
| José Viriato Capela | Universidade do Minho – Portugal |
| Justino Magalhães | Universidade de Lisboa |
| Leny Caselli Anzai | Universidade Federal de Mato Grosso |
| Leila Menezes Duarte | Arquivo Público do Estado do Rio de Janeiro |
| Ludovina Capelo | Arquivo da Universidade de Coimbra |
| Lucia Sanson | Rio de Janeiro (coordenação) |
| Marcelo Borges | Dickinson College-Carlisle, U.S.A. |
| Maria Engrácia Leandro | Universidade do Minho |
| Manoel Lelo Bellotto | Universidade Estadual Paulista-UNESP e Univ. de São Paulo-USP – Brasil |
| Manuela Aguiar | Associação da Mulher Emigrante |
| Manuel Carlos Ferreira da Silva | Universidade do Minho – Portugal |
| Manuel da Silva e Costa | Universidade do Minho – Portugal |
| Maria Adenir Peraro | Universidade Federal de Mato Grosso – Brasil |
| Maria Beatriz da Rocha-Trindade | Universidade Aberta – Portugal
Observatório da Emigração |
| Maria Cristina Moreira | Universidade do Minho |
| Marie Christine Volovitch Tavares | França (coordenação) |
| Maria Isabelle Vieira | Universidade de Rennes II |
| Maria Luiza Marcílio | Universidade de São Paulo – Brasil |
| Maria Manuela Rocha | Universidade Técnica de Lisboa – Portugal |
| Maria Norberta Amorim | NEPS (Núcleo de Estudos de População e Sociedade) U. do Minho , P |
| Maria Virgínia Arribal Coelho | Universidade Nova de Lisboa – Portugal |
| Miguel Bandeira | Universidade do Minho – Portugal |
| Miguel Monteiro | Museu da Emigração e das Comunidades |
| Miriam Halpern Pereira | (ISCTE) Portugal |
| Neide Antonia Marcondes de Faria | Universidade Estadual Paulista-UNESP e Universidade de São Paulo – USP – Brasil |
| Neide Fiori | Universidade de Florianópolis – Brasil |
| Nilce da Silva | Universidade de São Paulo USP – Brasil |
| Osvaldo Mário Serra Truzzi | Universidade Federal de São Carlos; UNESP e Universidade de São Paulo, USP |
| Regina Anacleto | Universidade de Coimbra – Portugal |
| Roberto Pestana Teixeira Lima | Universidade de Campinas (UNICAMP) – Brasil |
| Rui Carita | Universidade da Madeira – Portugal |
| Sebastião Gusmão | Universidade Federal de Minas Gerais – Brasil |
| Teresa Pinheiro | Universidade de Chemnitz – Alemanha |
| Teresa Rita Lopes | Universidade Nova de Lisboa |
| Wenceslau Gonçalves Neto | Universidade Federal de Uberlãndia |
| Todos os investigadores foram contactados e convidados pessoalmente pelo coordenador deste Museu, tendo todos eles declarado aceitar integrar este órgão. | |