O Museu da Emigração e das Comunidades propõe-se ter um âmbito nacional ao ser constituído por Núcleos Museológicos e Sítios Históricos da Emigração e do Retorno, organizando-se como um museu polinucleado, dado possuir extensões ou núcleos instalados em espaços físicos temáticos descentralizados do Museu distribuídos pela cidade.

Estes núcleos são unidades de memória que dependem do museu sede onde se situam os principais serviços técnicos, permitindo a adequada manutenção, desenhado para a valorização do espólio e das memórias de cada um deles e, do cumprimento das funções museológicas: investigar, preservar, comunicar.

Nestes lugares encontram-se os acervos documentais e museológicos de cada um dos núcleos, dando ao contexto de origem a compreensão dos factores de emigração, bem como os da visibilidade do retorno. Por outro lado, os sítios históricos constituem-se como referências espacio-temporais da saída ou retorno ou por terem sido obra da iniciativa directa de emigrantes. 

Por outro lado, o Museu está apoiado numa plataforma de informação concebida como uma construção de conteúdos para a dinamização de actividades de pesquisa, tendo como destinatários privilegiados os migrantes, descendentes e associações, nele envolvendo os estudiosos que centram os seus trabalhos nesta área temática, bem como aqueles que se encontram exilados ou refugiados, fundada em 12/07/2001

Inscreve as suas finalidades na perspectiva do conhecimento da emigração portuguesa, nela incluindo o fenómeno que se verificou para a África, bem como aquele que se verifica nos nossos dias, detendo-se, particularmente:

• na emigração para o Brasil (séc. XIX e primeiras décadas do XX)

• na emigração para os países Europeus (2.ª metade do séc.XX)

Funda a sua existência no facto da mobilidade geográfica constituir um fenómeno estrutural da sociedade portuguesa, deixando marcas em todos os continentes, não excluindo a emergência da imigração como uma nova expressão de mobilidade em Portugal.

Este projecto assenta, por outra lado, na visibilidade da descoberta dos efeitos da emigração nos territórios de destino e de retorno, e bem como nas expressões que reflectem o cruzamento de culturas, transformando-as em marcas patrimoniais de história económica, social e cultural.